Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms