Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc46a1Q6PEM8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms