Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrm2bQ6PEE3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrm2bQ6PEE3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms