Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI6

Mindy2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-2, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy2Q6PDI6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mindy2Q6PDI6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy2Q6PDI6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy2Q6PDI6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms