Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms