Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd4aQ6PDC8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms