Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab2Q6PAM0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms