Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atl2Q6PA06 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl2Q6PA06 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms