Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2d40Q6P8N9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp2d40Q6P8N9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp2d40Q6P8N9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp2d40Q6P8N9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms