Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Soga3Q6NZL0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms