Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms