Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HelbQ6NVF4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HelbQ6NVF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms