Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms