Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms