Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5416Q6IE28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5416Q6IE28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms