Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hecw2Q6I6G8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms