Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best3Q6H1V1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms