Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Carmil1Q6EDY6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Carmil1Q6EDY6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Carmil1Q6EDY6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Carmil1Q6EDY6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms