Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msl2Q69ZF8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msl2Q69ZF8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msl2Q69ZF8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msl2Q69ZF8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms