Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms