Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp9bQ66X22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp9bQ66X22 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms