Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms