Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2bQ64511 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Top2bQ64511 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms