Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pan3Q640Q5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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