Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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