Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga3Q62470 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms