Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vil1Q62468 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vil1Q62468 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms