Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20854Q62461 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms