Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms