Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms