Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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