Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox19Q62249 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms