Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm5dQ62240 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5dQ62240 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5dQ62240 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5dQ62240 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms