Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sin3bQ62141 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sin3bQ62141 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms