Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf1Q61999 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Odf1Q61999 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Odf1Q61999 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Odf1Q61999 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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