Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms