Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd53Q61451 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms