Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcolceQ61398 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PcolceQ61398 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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