Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc6Q61143 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc6Q61143 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc6Q61143 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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