Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis1Q60954 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis1Q60954 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis1Q60954 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms