Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Neurod1Q60867 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Neurod1Q60867 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms