Protein–RNA interactions for Protein: Q60850

Slc23a3, Solute carrier family 23 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a3Q60850 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc23a3Q60850 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc23a3Q60850 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc23a3Q60850 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc23a3Q60850 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc23a3Q60850 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc23a3Q60850 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms