Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppp1r1bQ60829 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppp1r1bQ60829 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppp1r1bQ60829 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp1r1bQ60829 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppp1r1bQ60829 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms