Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Mkrn3Q60764 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Mkrn3Q60764 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Mkrn3Q60764 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mkrn3Q60764 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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