Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG73

Acbd5, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd5Q5XG73 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acbd5Q5XG73 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acbd5Q5XG73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms