Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc125Q5U465 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc125Q5U465 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms