Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sco1Q5SUC9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sco1Q5SUC9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sco1Q5SUC9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sco1Q5SUC9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Sco1Q5SUC9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Sco1Q5SUC9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms