Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf215Q5SPX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms