Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms