Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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